В июне 2004 г. был проведен конкурс "Логотип Фонда Гейдара Алиева". На конкурсе были представлены около 2500 логотипов. Объединив элементы 2-х выбранных логотипов, был принят логотип Фонда Гейдара Алиева. Алиев Фаиг Беджан оглу и компания "Дедлайн" были объявлены победителями конкурса.
Логотип Фонда Гейдара Алиева состоит из восьмиконечной звезды, образованной из инициалов Гейдара Алиева "Н.Ə.". Элемент восьмиконечной звезды исходит из философии Заратушты: Небо, земля, вода, воздух, растения, животный мир, человечество, имя. В тюркизме это также указывает на развитие от простейшего до высшего. Значение восьмиконечной звезды, окружающей инициалы, заключается в объединении людей, азербайджанского народа вокруг своего великого лидера - Гейдара Алиева.
В логотипе используются два цвета: голубой и золотистый. Голубой цвет означает небо, демократия, честность, чистота, безвинность, покой, верность, надежность, искренность, уверенность, принадлежность тюркизму, а также философию "азербайджанства". Золотистый цвет является символом солнца, мира и развития светлого будущего.
Оба цвета отражают желания и идеи общенационального лидера Гейдара Алиева.